在亚美斯多利斯期间，爱德华?艾尔利克（朴璐美 饰）和弟弟阿尔方斯（钉宫理恵 饰）遭遇了还有两个月就可以刑满释放的越狱犯梅尔文（森川智之 饰），结果发现对方拥有不输于艾尔利克兄弟的强大炼金术。根据梅尔文在监狱留下的蛛丝马迹，兄弟二人前往西方的大国古雷达调查。在这里他们的火车遭到神秘黑蝙蝠的袭击，同时也

　　能说话、拥有自我意识的三辆交通工具型的机械生命体“炎神”。与喜欢破坏环境、制造污染公害的机械生命体蛮机族的三位大臣，在异世界 机械世界中交战。虽然炎神成功击退蛮机族，但是蛮机族的三位大臣却趁机从异世界 机械世界逃了出去。　　然后半年之后，人类所居住的地球突然出现了蛮机族，在地球环境被破坏殆尽之前